«Зенит» встречается с победителем пары:
«Динамо» (Санкт-Петербург) – «Истра» (Истра);

«Анжи» — с победителем пары:
«Балтика» (Калининград) – «Псков-747» (Псков);

ЦСКА — с победителем пары:
«Торпедо» (Москва) – «Химки» (Химки);

«Крылья Советов» — с победителем пары:
«Шинник» (Ярославль) – «Торпедо» (Владимир);

«Спартак-Москва» — с победителем пары:
«Динамо» (Брянск) – «Металлург» (Липецк);

«Сибирь» — с победителем пары:
«Авангард» (Курск) – «Звезда» (Рязань);

«Томь» — с победителем пары:
«Краснодар» (Краснодар) – «Жемчужина-Сочи» (Сочи);

«Амкар» — с победителем пары:
«Кубань» (Краснодар) – «Черноморец» (Новороссийск);

«Рубин» — с победителем пары:
«Волгарь-Газпром» (Астрахань) – «Торпедо» (Армавир);

«Ростов» — с победителем пары:
«Ротор» (Волгоград) – «Салют» (Белгород);

«Динамо» — с победителем пары:
«Сокол» (Саратов) – «Мордовия» (Саранск);

«Спартак-Нальчик» — с победителем пары:
«Нижний Новгород» (Нижний Новгород) – «Волга» (Нижний Новгород);

«Локомотив» — с победителем пары:
«Урал» (Екатеринбург) – «Горняк» (Учалы);

«Алания» — с победителем пары:
«Иртыш» (Омск) – «КАМАЗ» (Набережные Челны);

«Сатурн» — с победителем пары:
«Сахалин» (Южно-Сахалинск) – «СКА-Энергия» (Хабаровск);

«Терек» — с победителем пары:
«Луч-Энергия» (Владивосток) – «Радиан-Байкал» (Иркутск).

Матчи 1/32 финала, в которых определятся соперники команд клубов Премьер-Лиги, пройдут 1 июля 2010 г.

Матчи 1/16 финала Кубка России запланированы на 13 и 14 июля 2010 г. Все матчи на данной стадии соревнования команды клубов РФПЛ проводят в гостях.